對于 Windows NT，使用開始 --> 控制面板中的添加/刪除選項，或從開始 --> 程序 --> IBM WebSphere --> WebSphere應用服務器版本1.x 卸裝。
注重：當已安裝了某版本的 WebSphere應用服務器，它將復制Web 站點配置文件作為備份文件，然后修改原始配置文件。當使用 Web 服務器時這個已被修改過的文件就成為活動的配置文件。當卸裝 WebSphere應用服務器時，不會恢復以前的配置文件，它仍然是備份文件。為了使這些設置再次活動，必須將它們從備份文件轉換為活動的 Web 服務器配置文件。
另外，需要清除 CLASSPATH。安裝版本2.0之前要刪除這些信息。對于在 Windows NT 上使用Go Webserver 的Web服務器來說，當安裝 WebSphere應用服務器時能自動卸裝Go Webserver 上的 Java 支持。其它的請查閱有關文檔。
第三步：安裝WebSphere服務器： 在即將安裝 WebSphere應用服務器之前，請確保已經：
(1)備份所有未通過安裝程序自動備份的文件
(2) 安裝您計劃使用的 Web 服務器。Web 服務器必須在安裝 WebSphere應用服務器之前安裝。
(3) 安裝之前要確保Web 服務器已經停止運行。
注重：在WebSphere應用服務器的安裝期間，假如指定使用 IBM HTTP 服務器或 Apache Server，將提示您確認 Web 服務器 httpd.conf 文件的位置。
在 Windows NT 上，插入 WebSphere應用服務器安裝光盤，轉至以 Windows NT 操作系統命名的子目錄，運行可執行安裝程序（setup.exe）。一系列面板將指導您完成安裝。
ose.mode 屬性是用來控制WebSphere應用服務器是作為Web 服務器的一部分（進程內），還是在獨立模式下運行（進程外）。該屬性在 /properties/bootstrap.properties 文件中。ose.mode 缺省值是 out。Apache Server 或 IBM HTTP 服務器要求設置 ose.mode 屬性必須為 out，就是說WebSphere應用服務器必須運行在獨立模式下。對于其它 Web 服務器，可以將ose.mode 為 in 并且作為 Web 服務器的一部分運行 WebSphere應用服務器。 但是通常都不這么做。如有必要需要復位 ose.mode就是說將ose.mode的值設為out。例如，假如從作為 Webserver 一部分運行的 Netscape Enterprise Server （ose.mode=in）轉換為 IBM HTTP 服務器（要求 ose.mode=out），就別忘了在運行 IBM HTTP 服務器之前，要將ose.mode 屬性更改為 out。
除了可以手工編輯 bootstrap.properties 文件之外，治理器界面的 Java 引擎頁面提供了一個簡單的方法來鎖住該ose.mode屬性值。 Java 引擎頁面提供了一個可用來指示是以 Web 服務器的一部分（ose.mode=in）或以獨立模式（ose.mode=out）運行 WebSphere應用服務器的單選按鈕。
作為 Web 服務器一部分運行 WebSphere應用服務器為Servlet 和其它應用程序提供較高的性能，但安全性較差。作為 Web 服務器的一部分運行 WebSphere應用服務器，答應當關閉 Web 服務器時 WebSphere應用服務器自動停止。在獨立模式下運行 WebSphere應用服務器需要其它步驟。
啟動和停止 WebSphere應用服務器 在啟動 Web 服務器的時候，WebSphere應用服務器會自動啟動。
假如將 WebSphere應用服務器作為Web 服務器的一部分運行，當關閉 Web 服務器時 WebSphere應用服務器 將自動停止。假如以獨立模式運行，WebSphere應用服務器不會自動停止。
當在Windows NT 上進程外運行 WebSphere應用服務器 時，停止 Web 服務器之后，需要手動停止 WebSphere Servlet 服務以停止 WebSphere應用服務器。方法是：從開始 --> 設置 --> 控制面板 --> 中選擇 WebSphere Servlet 服務，并按“停止”按鈕。
