nginx貌似沒有虛擬目錄的說法，因為它本來就是完完全全根據目錄來設計并工作的。
如果非要給nginx安上一個虛擬目錄的說法，那就只有alias標簽比較“像”，干脆來說說alias標簽和root標簽的區別吧。
最基本的區別：alias指定的目錄是準確的，root是指定目錄的上級目錄，并且該上級目錄要含有location指定名稱的同名目錄。另外，根據前文所述，使用alias標簽的目錄塊中不能使用rewrite的break。
說不明白，看下配置：
location /abc/ {
    alias /home/html/abc/;
}
在這段配置下，http://test/abc/a.html 就指定的是 /home/html/abc/a.html。這段配置亦可改成
location /abc/ {
    root /home/html/;
}
這樣，nginx就會去找/home/html/目錄下的abc目錄了，得到的結果是相同的。
但是，如果我把alias的配置改成：
location /abc/ {
    alias /home/html/def/;
}
那么nginx將會從/home/html/def/取數據，這段配置還不能直接使用root配置，如果非要配置，只有在/home/html/下建立一個 def->abc的軟link（快捷方式）了。
一般情況下，在location /中配置root，在location /other中配置alias是一個好習慣。
至于alias和root的區別，我估計還沒有說完全，如果在配置時發現奇異問題，不妨把這兩者換換試試。
原文：http://www.sudone.com/nginx/nginx_alias.html

自己實踐總結：
1、使用alias時目錄名后面一定要加“/”
2、nginx、resin當虛擬目錄名與真實目錄同名時，虛擬目錄比真實目錄優先級要高。
3、前端nginx的虛擬目錄與后端resin真實目錄同名時，后端resin真實目錄優先級要高(即使resin也配制了同名的別名)。
4、nginx+resin/tomcat整合過程中，發現Nginx的虛擬目錄不能正確解析jsp，待解決。