在Windows Server 2003的IIS6下配置ISAPI方式的PHP，配置方法是，在IIS的“WEB服務擴展”中，添加一個新的WEB服務擴展，程序后綴為PHP，ISAPI程序為php5isapi.dll，然后再我的電腦->屬性->高級->“環境變量”-“系統變量”中增加變量名PHPRC，數值為php.ini的路徑，在Internet信息服務管理器中，選擇網站或應用程序的根目錄，打開目錄屬性頁(右鍵選擇“屬性”)，再選擇“主目錄”。點擊“配置”按鈕，選擇“映射”Tab頁。點擊“添加...”，在“可執行文件”設為: c:/php/php5isapi.dll，擴展名設為.php，選擇“確認文件是否存在”，然后“確定”保存設置。重啟服務器即可完成PHP的配置。

在用IIS整合php時，有兩種方式：ISAPI與CGI模式，這兩種方式，我們都可以看到phpinfo頁面，但是使用ISAPI模式，無法讀取環境變量，所以通過環境變量PHPRC設置的php.ini路徑無法找到。使用CGI就可以，這樣就不必把好多文件拷到系統文件下。

   
配置文件（PHP 3中是php3.ini，自PHP 4起是php.ini）在PHP啟動時被讀取。對于服務器模塊版本的PHP，僅在
web服務器啟動時讀取一次。對于CGI和CLI版本，每次調用都會讀取。
php.ini的搜索路徑如下（按順序）：
* SAPI模塊所指定的位置（Apache2中的PHPIniDir指令，CGI和CLI中的-c命令行選項，NSAPI
中的php_ini參數，THTTPD中的PHP_INI_PATH環境變量）
*HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/PHP/IniFilePath（Windows注冊表位置）
*PHPRC環境變量
*當前工作目錄（對于CLI）
*web服務器目錄（對于SAPI模塊）或PHP所在目錄（Windows下其它情況）
*Windows目錄（C:/windows或C:/winnt），或--with-config-file-path編譯時選項指定的位置
   
我在Server2003+php4的環境下遇見了這個問題，解決的方法是在前面寫PATH環境變量的時候，添加一個PHPRC，指向x:/php4/php.ini，重新啟動即可，如果實在還是不行的，最后還有一招就是安裝zend，php加速器，因為安裝zend的時候，會指定php.ini的路徑，也會指定所使用的服務器是IIS還是Apache，起本質是對注冊表做了修改，但是我不知道修改了哪個位置，所以我在上面的操作還是無效的情況下，最后安裝Zend，終于成功解決問題了。