TreeFam: Home page http://www.treefam.org/

[博士論文] Treefam數據庫的建立_百度文庫 http://wenku.baidu.com/link?url=4NR5N6TwlUyynORtiK_FrXkxPMQbm5BxKBYOx5cdSDOCWxXAuE24Dr3nrEcifgcJkHSFAf0Ihl8SBtfFDXEmAepSe3ya8icaHv1POePu3AK

算法： 1.約束鄰接法：高效重構整個進化樹而不改變子樹的拓撲結構 可保留人工校正結果 2.葉節點重排算法：保證葉節點以接近指定的順序在平面排列 可讓相似的樹實現相似的平面視覺效果 3.推斷基因倍增和缺失算法：物種樹多分岔的情況 4.樹合并算法：結合多棵從同一序列集構造的基因樹 通過減少可推斷出倍增，缺失事件和選擇較高的自展支持 構建出一棵超越所有備選樹的最優樹

簡約法和最大似然法不能取代距離法