通常網頁有病毒，都是文件給修改嵌套進了病毒代碼。 原因有以下幾種可能：
1）、網站程序有SQL注入漏洞與組件上傳漏洞，黑客利用來上傳Web木馬從而在Web上直接修改網頁文件。
2）、FTP密碼泄漏。

絕大多數的空間都是因為第一種原因而導致的。 建議按以下幾個步驟處理：
1）、修改您的FTP密碼。
2）、檢查FTP下的所有文件，如有可疑文件下載查看。確認是木馬文件后刪除。
3）、找程序員修補程序漏洞。

簡單的清理已給嵌入病毒的文件可以按以下做法：
1）、下載有病毒提示的文件頁面，如index.asp。
2）、用編輯器打開，搜索。
3）、重新上傳修改后的文件。