花了很久時間，終于搞定了IIS6和Tomcat的整合。現在把步驟貼出來給各位一點參考，也免去了新手在Google上暴走和一次次的調試。開始吧！
　　首先先說明我的系統，Windows 2003 Server中文版+IIS6+Tomcat5.0.14，JDK 1.4.2安裝目錄為C:/JDK,Tomcat安裝目錄為C:/Tomcat,環境變量JAVA_HOME和TOMCAT_HOME都已設置好并指向其各自的安裝目錄。(注意，接下來所有文件中涉及到tomcat路徑的請自行修改為自己的Tomcat路徑)
　　Tomcat5和IIS6的安裝我就不說了，網上的文檔很多，假定此時我們已經安裝好了Tomcat5和IIS6并都能獨立運行，兩者的默認網站均指向C:/web目錄。
　　
　　現在我們要做的是到http://apache.linuxforum.net/dist/jakarta/tomcat-connectors/jk2/binaries/win32/jakarta-tomcat-connectors-jk2.0.2-win32-IIS.zip　去下載JK2,由JK2負責IIS和Tomcat的通訊，解開后得到isapi_redirector2.dll，我把它放在了C:/tomcat/iis下（目錄隨便）。
　　接下來在Tomcat安裝目錄下的conf目錄下建一個workers2.properties文件，把下面這段東東拷進去保存。注意file=".."之中的路徑要用"/"哦！

[shm]
file=c:/Tomcat/logs/jk2.log
size=1048576

# 實際運用時把所有的localhost和8009換成你自己的IP和端口
[channel.socket:localhost:8009]
port=8009
host=localhost

# define the worker
[ajp13:localhost:8009]
channel=channel.socket:localhost:8009

# Uri mapping
[uri:/*.jsp]
[uri:/web/*]
worker=ajp13:localhost:8009

# define the worker
[status:status]

# Uri mapping
[uri:/jkstatus/*]
worker=status:status

　　之后編輯jk2.properties文件，確認其中是否有此一句：

　　request.tomcatAuthentication=false

　　接下來開始編輯注冊表，直接建一個iis.reg文件，把下面一段拷進去保存然后雙擊iis.reg把信息導入注冊表。(注意，把涉及的Tomcat路徑改成你的Tomcat的路徑)

　　Windows Registry Editor Version 5.00

　　[HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Apache Software Foundation/Jakarta Isapi Redirector/2.0]
　　"serverRoot"="c://Tomcat"
　　"extensionUri"="/jakarta/isapi_redirector2.dll"
　　"workersFile"="c://Tomcat//conf//workers2.properties"
　　"logLevel"="INFO"

　　然后打開“我的電腦－>控制面板－>管理工具－>Internet信息服務管理器”，在里面選擇“網站”中的默認網站（默認網站我假定指向C:/web），在其上點右鍵選“屬性”，在彈出的頁框里選擇“ISAPI篩選器”，點“添加”，篩選器名稱填jakarta,可執行文件中填入你的isapi_redirector2.dll的絕對路徑?！按_定”后點“確定”關閉屬性頁。再在“默認網站”上右鍵，選擇“新建”－>“虛擬目錄”，別名填jakarta，下一步，路徑選為你的isapi_redirector2.dll存放的目錄，我的是C:/tomcat/iis，下一步，權限中記得把“執行”那項打勾，好了，完成。
　　如果你用的是IIS5的話，到這里就可以結束了，但IIS6還沒完，繼續。
　　在“Internet信息服務管理器”的“網站”中的“Web服務擴展”上點右鍵選擇“添加一個新的Web服務擴展”，彈出的框中擴展名填Tomcat(其實無所謂的)，“要求的文件”選“添加”然后找到你的isapi_redirector2.dll后“確定”。“設置擴展狀態為允許”也打上勾，確定。
　　好了，配置完了?，F在我們啟動Tomcat5，然后net start w3svc啟動IIS6。鍵入http://localhost:8080/hello.jsp(這個文件是我放在c:/web下的)看看！然后在看看http://localhost/hello.jsp，如果兩者執行結果一樣，恭喜你，整合成功了！

　　但或許此時還不行，這時你該確認以下幾點：
　　1.你的“Internet信息服務管理器”->“網站”->“默認網站”->“屬性”->“ISAPI篩選器”中的jakarta是否是向上的綠色箭頭？如果是紅色的，檢查一下你之前做的配置有沒有少了或是寫錯了點什么，再重新配置一遍
　　2.確認你的Tomcat安裝目錄下的common/lib目錄中是否有tools.jar文件（Tomcat5好像是有的，但Tomcat4中是沒有的，網上的文檔很少提到這件事，致使我多次配置失?。?，沒有的話從JDK的lib下拷一個過去。
　　3.IIS指向的目錄最好和Tomcat指向的目錄一致，不然會發生找不到圖像和其他資源文件的問題。(這點不影響執行，呵呵!)
　　4.英文文檔中還提到應該把IIS6設置為IIS5隔離模式，“Internet信息服務管理器”->“網站”->“屬性”->“服務”，把“以IIS5.0隔離模式運行WWW服務”打上勾。不過我不打勾也能正常使用，如果你配置不成功也可以試試這個。

　　還不行？好，我們來狠的，打開機箱，取出硬盤，扔到地上給我踩，踩，踩！看你還敢跟我頂^_^（開個玩笑，不過之前我配置多次失敗后確實有些無奈和懊惱）
　　此文實際也等于是轉載，我只是負責輸入而已，如有錯誤請指出！歡迎各位與我交流，ymer@21cn.com，JSP程序員，EJB學習中......

　　參考網址:https://www.rit.edu/~ack5504/tomcat-iis6-howto/tomcat-iis6-howto.html
 　　　　　　http://www.knowsky.com/3181.html