1、USB-HDD 
硬盤仿真模式，DOS啟動后顯示C:盤，HP U盤格式化工具制作的U盤即采用此啟動模式。此模式兼容性很高，但對于一些只支持USB-ZIP模式的電腦則無法啟動。 

2、USB-ZIP 
大容量軟盤仿真模式，DOS啟動后顯示A盤，FlashBoot制作的USB-ZIP啟動U盤即采用此模式。此模式在一些比較老的電腦上是唯一可選的模式，但對大部分新電腦來說兼容性不好，特別是大容量U盤。 

3、USB-HDD+ 
增強的USB-HDD模式，DOS啟動后顯示C:盤，兼容性極高。其缺點在于對僅支持USB-ZIP的電腦無法啟動。 

4、USB-ZIP+ 
增強的USB-ZIP模式，支持USB-HDD/USB-ZIP雙模式啟動(根據電腦的不同，有些BIOS在DOS啟動后可能顯示C:盤，有些BIOS在DOS啟動后可能顯示A:盤)，從而達到很高的兼容性。其缺點在于有些支持USB-HDD的電腦會將此模式的U盤認為是USB-ZIP來啟動，從而導致4GB以上大容量U盤的兼容性有所降低。 

5、USB-CDROM 
光盤仿真模式，DOS啟動后可以不占盤符，兼容性一般。其優點在于可以像光盤一樣進行XP/2003安裝。制作時一般需要具體U盤型號/批號所對應的量產工具來制作，對于U3盤網上有通用的量產工具。