作為操作系統，GNU的發展仍未完成，其中最大的問題是具有完備功能的內核尚未被開發成功。GNU的內核，稱為Hurd，是自由軟件基金會發展的重點，但是其發展尚未成熟。在實際使用上，多半使用Linux內核、FreeBSD等替代方案，作為系統核心，其中主要的操作系統是Linux的發行版。Linux操作系統包涵了Linux內核與其他自由軟件項目中的GNU組件和軟件，可以被稱為GNU/Linux（見GNU/Linux命名爭議）。

組成

主條目：GNU軟件包列表

該系統的基本組成包括GNU編譯器套裝（GCC）、GNU的C庫（glibc）、以及GNU核心工具組（coreutils），另外也是GNU除錯器（GDB）、GNU二進制實用程序（binutils）的GNU Cashshell中和GNOME桌面環境。GNU開發人員已經向GNUhtml' target='_blank'>應用程序和工具的Linux移植，現在也廣泛應用在其它操作系統中使用，如BSD變體的Solaris，和OS X作出了貢獻。

許多GNU程序已經被移植到其他操作系統，包括專有軟件，如Microsoft Windows和OS X.GNU計劃已經被證明是比他們的專有Unix更為可靠。截至2015年11月，全國共有466 GNU軟件包（包括退役，但不包括383 ）主辦的官方GNU開發的網站。

GNU 變種

主條目：GNU variants

GNU項目的官方核心是GNU Hurd；然而，截至2012年，Linux核心正式以Linux-libre為名成為GNU項目中的一部分，并刪除了所有專有組件的變種.

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