WinPE系統提供了三種方法啟動自定義腳本：Winpeshl.ini、Startnet.cmd 和 Unattend.xml。WinPE的默認界面是“命令提示符”窗口。但可以創建自定義的Winpeshl.ini文件，以便運行自己的外殼應用程序。也可以創建自己的 Startnet.cmd批處理文件來運行特定的命令集、批處理文件或腳本。Unattend.xml是WinPE 2.0的新應答文件格式，它取代了Winbom.ini和Winpeoem.sif。

　　在添加任何自定義腳本之前，必須先使用ImageX應用或裝入基本WinPE映像 (WinPE.wim)。

　　1、使用Winpeshl.ini添加自定義腳本，可以使用名為Winpeshl.ini的文件啟動自定義外殼應用程序。Winpeshl.exe將在啟動期間處理Winpeshl.ini中的設置。使用文本編輯器(如記事本)創建具有以下結構的Winpeshl.ini文本文件。例如：

　　[LaunchApp]

　　AppPath = %SYSTEMDRIVE%myshell.exe

　　[LaunchApps]

　　%SYSTEMDRIVE%mydirapplication1.exe, -option1 -option2

　　application2.exe, -option1 -option2

　　注：將AppPath項設置為外殼應用程序的路徑。此路徑可以是完全限定路徑，也可以使用環境變量，例如%SYSTEMROOT%System32Myshell.exe。AppPath 項不支持命令行選項。將此文件保存至WinPE映像的%SYSTEMROOT%System32。

　　2、使用Startnet.cmd添加自定義腳本，使用Startnet.cmd可以在WinPE中添加自定義命令行腳本。默認情況下，WinPE包括Startnet.cmd腳本，此腳本位于WinPE映像的 %SYSTEMROOT%System32 中。當前，Startnet.cmd啟動Wpeinit.exe。Wpeinit.exe 用于安裝即插即用 (PnP) 設備、處理 Unattend.xml 設置以及加載網絡資源。編輯Startnet.cmd 以包括自定義命令。

　　注意：對于PnP和網絡支持，請確保在自定義Startnet.cmd腳本中包含了對wpeinit的調用。

　　3、運行imagex /info d:boot.wim，查看WinPE映像的信息。我們要注意這一行：

　　Image Count: 2

　　說明此WinPE映像文件中其實包含了兩個映像。每個映像的詳細信息在后面有詳細的顯示。這里要特別說明的是我們需要編輯的是第二個名稱為WDS的映像，因為WDS使用此映像引導計算機。

　　使用imagex命令加參數mountrw先將 *.wim 加載到pemount目錄中：

　　imagex /mountrw c:winpe2pe2.wim 2 c:pemount

　　使用peimg命令將第三方驅動添加到WinPE 2.0中，如需添加多個設備驅動請重復該步驟。

　　peimg /inf=c:winpe2netdrvxxx.inf c:pemountwindows

　　使用imagex命令加參數unmount及commit將修改寫入到 *.wim

　　imagex /unmount c:pemount /commit